CSC

 
 
Tehdyt toimenpiteet

Bioinformatiikan sanasto

    Tyryhm:

      Erja Heikkinen, CSC - Tieteellinen laskenta Oy
      Marjo Korpi, Tampereen yliopisto, Lketieteellisen tekniikan instituutti
      Kimmo Mattila, CSC - Tieteellinen laskenta Oy
      Ilkka Porali, Joensuun yliopisto, biologian laitos
      Mauno Vihinen, Tampereen yliopisto, Lketieteellisen tekniikan instituutti

Johdanto

Bio- ja tietoteknologian kehittyminen avaa jatkuvasti uusia mahdollisuuksia biotieteiden tutkimuksessa. Biologisen ja lketieteellisen informaation tietokoneavusteisesta kermisest, prosessoinnista ja analysoinnista on syntynyt uusi kasvava tieteenala, jota kutsutaan bioinformatiikaksi. Bioinformatiikan kirjallisuutta tai muuta opetusmateriaalia on julkaistu vasta vhn, varsinkaan suomen kielell, ja terminologia on epyhtenist. Tst syyst suomalaisista bioinformatiikka-asiantuntijoista koostuva Bioverkko ptti koota bioinformatiikan keskeist sanastoa tukemaan bioinformatiikan opetusta sek uusia bioinformatiikan kyttji ja tutkijoita. Tavoitteena oli, ett sanasto toimisi osaltaan siltana bioinformatiikassa yhdistyvien tieteenalojen vlill.

Bioinformatiikan sanaston ensimmiseen versioon on pyritty kokoamaan trkeimmt bioinformatiikan termit. Lisksi mukaan on otettu bioinformatiikkaan lheisesti liittyvien tieteenalojen ja tekniikoiden (molekyylibiologia, tietojenksittely) termej, jotka esiintyvt usein bioinformatiikan yhteydess. Sanastoon on mys koottu joukko yleisesti kytettyj bioinformatiikan algoritmej, ohjelmistoja ja tietokantoja. Niden suhteen sanastoa voidaan pit vain suuntaa-antavana kokoelmana. Ohjelmistoja, tietokantoja ja verkkopalveluita on tarjolla niin runsaasti, ett objektiivinen trkeimpien bioinformatiikan tykalujen ja tietolhteiden valikoiminen nin lyhyeen listaan lienee mahdotonta.

Haluamme kiitt kaikkia sanaston valmistelussa avustaneita henkilit. Erityisesti Manne Miettist sanaston XML-sivujen tuottamisesta. Jouni Aspia, Juha Haatajaa, Liisa Laakkosta, Tapio Salakoskea, Pekka Uimaria, Esko Ukkosta ja Imre Vstriki haluamme kiitt sanastosta annetusta palautteesta.

Sanastoa kehitetn edelleen ja se pyritn pvittmn saadun palautteen perusteella noin kerran vuodessa. Kaikki sanastoa koskeva palaute on tervetullutta. Listtess sanastoon uusia termej tulee ppaino olemaan bioinformatiikan tieteellisiss termeiss. Ohjelmistojen ja palvelinten nimist, samoin kuin tietotekniikan ja molekyylibiologian termej listn vain, mikli ne katsotaan bioinformatiikan kannalta erityisen trkeiksi. Palautteen voi lhett Erja Heikkiselle osoitteeseen: Erja.Heikkinen@csc.fi.

Espoossa 5.12. 2000
Sanastotyryhm